StepwisePlus
Kurslara DönUygulamalı Yeni Nesil Dizileme (NGS) ve Genomik Analiz
Uygulamalı Yeni Nesil Dizileme (NGS) ve Genomik Analiz
İleri Düzey

Uygulamalı Yeni Nesil Dizileme (NGS) ve Genomik Analiz

Klinik ve araştırma uygulamaları için profesyonel genomik ardışık düzenler (pipelines) kurun ve çalıştırın.

5 saat 55 dkİleri
Eğitmen
Yasin Polat
01

Klinik analiz pipeline'ları geliştiren biyoinformatikçiler

02

NGS verilerini analiz eden genetikçiler ve moleküler biyologlar

Bu Kursta Öğrenecekleriniz

Uçtan uca NGS biyoinformatik ardışık düzenleri tasarlamak ve yürütmek
Ham dizileme verileri üzerinde titiz bir kalite kontrol (QC) süreci uygulamak
GATK en iyi uygulamalarını (best practices) kullanarak klinik germline varyantlarını tespit ve anote etmek
Diferansiyel gen ekspresyonu için RNA-Seq verilerini işlemek ve analiz etmek
Klinik veya araştırma raporlaması için karmaşık VCF dosyalarını yorumlamak

Kurs Hakkında

Ham dizileme okumalarından klinik yorumlamaya kadar tüm biyoinformatik analiz ardışık düzeninde (pipeline) uzmanlaşın. Bu ileri düzey kurs; kalite kontrol, dizi hizalama ve güçlü varyant çağırımı metodolojilerini kapsarken, özellikle germline (germ hattı) analizleri ve transkriptomik üzerine odaklanmaktadır.

Müfredat

9 ders · 2 ücretsiz önizleme

1
Dizileme teknolojilerine giriş ve FASTQ formatlarıÜcretsiz
25 dk
2
FastQC ve MultiQC ile okuma kalitesi değerlendirmesiÜcretsiz
30 dk
3
Adaptör kesimi ve düşük kaliteli okumaların filtrelenmesi
35 dk
1
Referans genoma hizalama algoritmaları (BWA-MEM & Bowtie2)
45 dk
2
SAM/BAM dosya işleme ve PCR duplikasyonlarının işaretlenmesi
35 dk
3
GATK HaplotypeCaller ile germline varyant çağırımı (Variant Calling) ardışık düzenleri
55 dk
4
VCF anotasyonu ve klinik filtreleme stratejileri
40 dk
1
RNA-Seq okumalarının hizalanması ve sayısallaştırılması
40 dk
2
DESeq2 ile diferansiyel gen ekspresyon analizi
50 dk

Ön Koşullar

  • Linux/Unix komut satırı ortamına (CLI) aşinalık
  • Moleküler genetik ve dizileme mantığına temel düzeyde hakimiyet
  • Python veya R programlama dillerinden en az birinde tecrübe (Tavsiye edilir)

Kimler İçin

Klinik analiz pipeline'ları geliştiren biyoinformatikçiler
NGS verilerini analiz eden genetikçiler ve moleküler biyologlar
Tüm ekzom (WES) veya tüm genom (WGS) dizileme projelerinde çalışan araştırmacılar

Eğitmen

Yasin Polat

Bioinformatician & Araştırmacı

Klinik biyoinformatik analiz ardışık düzenleri, germline varyant analizi ve omik veri entegrasyonu konularında uzmanlaşmış hesaplamalı biyolog.

Kurs Detayları

Seviye

İleri

Toplam Süre

5 saat 55 dk

Eğitim Türü

Canlı Eğitim

Dil

Türkçe

Sertifika

Dahil

Son Güncelleme

2026-02

Sıkça Sorulan Sorular

Platformumuzda hem canlı hem de kayıtlı eğitimler bulunmaktadır; ilgilendiğiniz kursun türünü sayfanın üst kısmındaki 'Eğitim Türü' bölümünden görebilirsiniz. Canlı eğitimlerimiz ise tamamen etkileşimli olarak, eğitmenle eş zamanlı gerçekleştirilmektedir.

Pek çok canlı dersimiz kaydedilmekle birlikte, bu durum eğitime göre değişiklik gösterebilir. Eğer eğitim kaydediliyorsa, ders kayıtlarına profiliniz üzerinden erişebilirsiniz. Kesin bilgi için ilgilendiğiniz kursun açıklama metnini inceleyebilirsiniz.

Sorularınızı canlı ders esnasında veya platform üzerindeki tartışma alanından doğrudan eğitmene iletebilirsiniz. Ayrıca kursa özel iletişim gruplarından (WhatsApp vb.) diğer katılımcılarla etkileşimde kalabilirsiniz.

Sertifika programına dahil olan eğitimleri başarıyla tamamladığınızda size özel, doğrulanabilir bir bitirme sertifikası düzenlenmektedir. Bu sertifikayı özgeçmişinize ve LinkedIn profilinize tek tuşla ekleyebilirsiniz.

Kursa bağlı olarak gerekli yazılımların kurulumları genellikle eğitimin ilk aşamasında adım adım gösterilmektedir. Özel bir sistem gereksinimi olan kurslarda bu durum kurs sayfasındaki 'Ön Koşullar' bölümünde belirtilmektedir.

Öğrenilen teorik bilgilerin pratiğe dökülmesi için kurs süresince veya modül bitiminde uygulamalı projeler ("hands-on" görevler) verilmektedir. Bu görevleri tamamlayarak eğitmen geri bildirimi alırsınız.

Ücretsiz

Hemen Başla

Kariyerini bir adım öteye taşı. Hemen kaydol, fırsatı kaçırma.